まだ温かい状態で型から外していないか、確認してみてください。シフォンケーキは焼き上げたあと、中心までしっかり冷やしてから型出しするのが基本です。温かいうちに外すと、メレンゲの気泡がしぼんでしまいます。
手順の目安です。オーブンから取り出したら、すぐに逆さまにして粗熱をとります（ここで逆さまにしないことも、しぼみの原因になります）。粗熱がとれたらラップをして、逆さまのまま冷蔵庫で冷やします。しっかり冷えたら焼き目を上に戻して大丈夫です。そこまで冷えて、はじめて型出しできる状態になります。
冷蔵庫ではなくお部屋で冷やしても大丈夫？というご質問もいただきます。冬場、10℃以下の寒い室内なら問題なく冷えます。ただしシフォンケーキは乾燥が苦手なので、必ずラップまたはビニール袋で包んで冷やしてください。